Under 2016 blev renoveringen av orgeln i Lysekils kyrka klar. Orgeln är byggd 1917 av Eskil Lundén i Göteborg. Fasaden är från 1901 (samtida med kyrkan) och ritad av Adrian Crispin Pettersson. Bakom denna fasad stod först Molanderorgeln som var byggd 1879 för gamla kyrkan. Under 1950-talet gjordes en mindre omdisponering av orgeln. 2006 inträffade ett svårt oväder med regn och hårda vindar. Detta gjorde att det drev in vatten i tornet och i orgeln. Sedan tornet och kyrkans bakvägg stått och torkat i några år monderades delar av orgeln ner så att bakväggen kunde renoveras. Under tiden bakväggen torkat ramlade det dessutom ner väggputs i orgeln.
Vid renoveringen återställdes de dispositionsförändringar som gjorts på 1950-talet.